Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GBX1Q14549 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GBX1Q14549 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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