Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VGLL4Q14135 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VGLL4Q14135 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms