Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGB1Q14028 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNGB1Q14028 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
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