Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PDE7AQ13946 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE7AQ13946 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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