Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SF3B2Q13435 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SF3B2Q13435 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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