Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
XRCC4Q13426 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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