Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3B2Q13367 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3B2Q13367 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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