Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATMQ13315 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATMQ13315 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATMQ13315 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATMQ13315 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATMQ13315 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATMQ13315 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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