Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRDNQ13061 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRDNQ13061 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms