Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PRDM2Q13029 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRDM2Q13029 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
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