Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CNTN1Q12860 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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