Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF3C1Q12789 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms