Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NUP160Q12769 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP160Q12769 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP160Q12769 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
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