Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RBBP4Q09028 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP4Q09028 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms