Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSRP1Q08945 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSRP1Q08945 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms