Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP3CAQ08209 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms