Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CKAP4Q07065 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms