Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SOX4Q06945 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SOX4Q06945 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms