Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABPAQ06546 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms