Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPTBN1Q01082 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPTBN1Q01082 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms