Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms