Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYBPC1Q00872 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms