Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX3P78415 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRX3P78415 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRX3P78415 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRX3P78415 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRX3P78415 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms