Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P63121 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms