Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVK11-1P61568 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms