Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA9P57773 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA9P57773 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA9P57773 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA9P57773 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA9P57773 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA9P57773 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms