Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms