Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIK1P57059 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIK1P57059 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIK1P57059 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIK1P57059 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIK1P57059 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIK1P57059 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIK1P57059 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms