Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP9P55211 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP9P55211 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP9P55211 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms