Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASP7P55210 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP7P55210 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP7P55210 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASP7P55210 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASP7P55210 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CASP7P55210 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms