Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YARSP54577 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YARSP54577 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YARSP54577 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YARSP54577 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YARSP54577 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YARSP54577 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YARSP54577 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YARSP54577 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YARSP54577 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YARSP54577 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms