Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSBP53539 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOSBP53539 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOSBP53539 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms