Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NKX2-5P52952 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NKX2-5P52952 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms