Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYB561P49447 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYB561P49447 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYB561P49447 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYB561P49447 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYB561P49447 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYB561P49447 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYB561P49447 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYB561P49447 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms