Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PIP4K2AP48426 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms