Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RFX3P48380 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RFX3P48380 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RFX3P48380 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RFX3P48380 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RFX3P48380 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RFX3P48380 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms