Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPS9P46781 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPS9P46781 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPS9P46781 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS9P46781 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS9P46781 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS9P46781 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS9P46781 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPS9P46781 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms