Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-1P43699 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms