Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5C1P36542 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5C1P36542 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms