Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHI3L1P36222 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHI3L1P36222 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms