Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT2P35908 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT2P35908 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT2P35908 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT2P35908 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms