Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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