Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ABCC1P33527 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms