Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC27P30260 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC27P30260 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC27P30260 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms