Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PLNP26678 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PLNP26678 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PLNP26678 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PLNP26678 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PLNP26678 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms