Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DNMT1P26358 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DNMT1P26358 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms