Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms