Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNCP24821 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNCP24821 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNCP24821 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNCP24821 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms