Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NF1P21359 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NF1P21359 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NF1P21359 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NF1P21359 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms