Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB4P16144 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms